ISSN: 1300-7777 E-ISSN: 1308-5263
Cloning of chimerical translocations as positive control for molecular genetic diagnosis of leukemia [Turk J Hematol]
Turk J Hematol. 2008; 25(1): 20-23

Cloning of chimerical translocations as positive control for molecular genetic diagnosis of leukemia

Duran Ustek1, Sema Sırma1, Aris Cakiris1, Fulya Coşan2, Başar Oku1, Uğur Özbek1
1Experimental Medical Research Institute, Istanbul, Turkey
2Department Of Internal Medicine, Istanbul Medical Faculty, Istanbul, Turkey

The diagnosis of leukemia-specific mRNAs by polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcription-PCR (RT-PCR) require well-known positive standard controls. In general, the positive controls are obtained from cell lines and leukemia patients who have been diagnosed at the molecular level by RT-PCR. These are expensive and restricted sources for standard positive controls. Thus, there is a need for less expensive and reproducible standard positive controls in this area. We have cloned the t (9: 22) p190, t (9: 22) p210, t (4: 11), t (1: 19), t (15: 17), t (12; 21) breakpoint junctions of fusion genes into the plasmids. Cloned fusion genes are suitable for testing PCR experiments of the molecular genetic diagnosis of leukemia samples. We cloned and optimized fusion gene junctions as a standard positive control to check PCR efficiency and as a standard positive marker for diagnosis.

Keywords: Fusion genes, cloning, reverse transcription-PCR


Lösemilerin moleküler genetik teşhisinde kullanılmak üzere arnslokasyonların pozitif standart amaçlı olarak klonlanması

Duran Ustek1, Sema Sırma1, Aris Cakiris1, Fulya Coşan2, Başar Oku1, Uğur Özbek1
1Experimental Medical Research Institute, Istanbul
2Department Of Internal Medicine, Istanbul Medical Faculty, Istanbul

Lösemiye özgü kimerik mRNA’ların ters transkriptaz PCR ile saptanmasında standart Kontrollerin olması oldukça önemlidir. Lösemi hastalarından elde edilen kimerik genlere ait pozitif örnekler veya hücre hatlarından elde edilen standartlar yaygın olarak kullanılmaktadır. Gerek hasta örnekleri, gerekse hücre hatlarından elde edilen pozitif kontroller, kısıtlı, pahalı ve bir çok sorunlar oluşturmaktadır. Daha ucuz, tekrar üretilebilir standartların üretilmesi ihtiyaç haline gelmiştir. Biz p190, t (9: 22) p210, t (4: 11), t (1: 19), t (15: 17), t (12; 21) kimerik gen bölgelerini plasmidlere klonlayarak daha ucuz ve tekrar üretilebilen standart pozitif kontrolleri ürettik. Bu plasmidler, lösemilerin moleküler genetik teşhisinde standart pozitif marker olarak PCR ve RT-PCR sırasında kullanılabilir inancını taşımaktayız.

Anahtar Kelimeler: Füzyon genler, klonlama, ters transkriptaz PCR


Duran Ustek, Sema Sırma, Aris Cakiris, Fulya Coşan, Başar Oku, Uğur Özbek. Cloning of chimerical translocations as positive control for molecular genetic diagnosis of leukemia. Turk J Hematol. 2008; 25(1): 20-23

Corresponding Author: Duran Ustek, Türkiye


TOOLS
Full Text PDF
Print
Download citation
RIS
EndNote
BibTex
Medlars
Procite
Reference Manager
Share with email
Share
Send email to author

Similar articles
PubMed
Google Scholar


 



Impact Factor (2016) = 0.686